他(马勒伯朗士)还提出了一个神学性质的论据，这个论据十分动人：动物不会感到痛苦，因为痛苦是原罪的后果，然而，动物却从未偷食禁果，因此，动物不会感到痛苦，痛苦会是对它们的不公，因为它们并未犯下罪行。只有人类才会感到痛苦。这就是为什么我们把狗剖开，挂在谷仓的门梁上，看着它们流血，这也是皇港修道院（Port-Royal）的先生们想看到的结果，他们批准对动物进行活体解剖，因为动物不会感到痛苦。
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尽管如此，圣奥古斯丁认为，在动物那里切都出自本能，动物不同的技能与技巧都被解释为感觉、想象与记忆，并没有灵魂的介入，至少没有理性灵魂，也就是说没有类似人类灵魂之物介入，因为人类灵魂是具有道徳观念与理性活动的。
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颂扬动物、说明人不必要因自身的人性而扬扬得意，因为归根结底，人并不比动物高级，甚至与之截然相反，因为人会犯错，所以才不得不依靠理性，而动物完全不需要这种理性，这便显示出它们的优越性，动物更直接地与自然联系在一起。因为当我们说这些的时候，我们便以隐含的方式承认：理性进程，实际上就是学习的进程，区别于动物的本性驱动或本能的进程，后者更加直接，是一种更加直接的行为。
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拥有灵魂、拥有理性能力，通过拥有精神的事实，人可以战胜所有困难，并且力图经受住考验，这一切都是借助逐步累积、解决问题的方法（提出问题，然后解决问题）实现的。因此，笛卡尔否定了动物的意识，特别是否定了动物获得理性、智性学习、灵巧解决问题的能力。他由此创立了动物行为的机械论，而摒弃了本能的观念。